Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPS1P31327 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPS1P31327 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPS1P31327 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPS1P31327 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPS1P31327 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CPS1P31327 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms