Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA10P31260 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms