Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPREP23469 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPREP23469 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPREP23469 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPREP23469 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPREP23469 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms