Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD247P20963 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD247P20963 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD247P20963 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms