Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HNF1AP20823 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms