Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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