Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPI1P17947 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms