Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DESP17661 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DESP17661 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DESP17661 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DESP17661 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DESP17661 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms