Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB3P16520 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms