Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP3P12645 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP3P12645 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BMP3P12645 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms