Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms