Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms