Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RARBP10826 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RARBP10826 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARBP10826 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARBP10826 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARBP10826 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARBP10826 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARBP10826 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARBP10826 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARBP10826 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARBP10826 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms