Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL3P10147 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL3P10147 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL3P10147 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL3P10147 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms