Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM10L1P0DMW3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms