Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APELAP0DMC3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APELAP0DMC3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APELAP0DMC3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms