Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms