Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRPRAP08240 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRPRAP08240 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRPRAP08240 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms