Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLK3P07288 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLK3P07288 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLK3P07288 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLK3P07288 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms