Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB2P05107 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms