Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
APOA1P02647 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms