Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBE1P02100 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBE1P02100 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms