Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINA1P01009 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms