Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms