Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms