Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRPM2O94759 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPM2O94759 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms