Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRMUO75648 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRMUO75648 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRMUO75648 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms