Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms