Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH6O60337 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH6O60337 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms