Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms