Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms