Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ3O43525 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms