Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCAO15360 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FANCAO15360 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FANCAO15360 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FANCAO15360 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms