Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms