Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BCKDKO14874 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms