Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APAF1O14727 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APAF1O14727 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APAF1O14727 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APAF1O14727 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APAF1O14727 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms