Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01387J3KSC0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms