Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E9PBE3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E9PBE3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E9PBE3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E9PBE3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms