Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATL2C9JE40 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms