Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms