Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms