Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms