Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA3AA6NCI4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms