Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP5LA4QPB2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP5LA4QPB2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms