Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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