Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SSX1Q16384 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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SSX1Q16384 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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SSX1Q16384 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SSX1Q16384 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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SSX1Q16384 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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SSX1Q16384 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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SSX1Q16384 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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