Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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