Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms