Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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