Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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